Estamos em 1967, e um jovem japonês pensa no seu futuro enquanto volta para casa, numa longa viagem noturna de barco. É aqui que ele conhece e se apaixona por uma jovem misteriosa que tem uma história inacreditável: Emanon… A experiência é breve e logo se separam, mas ela deixa memórias que ele jamais esquecerá, assim como sua existência ficará para sempre gravada nas memórias de Emanon.